Tout comme le miel, le pollen est un aliment à faible teneur en eau (moins de 20%). Même placé au congélateur, ses pelotes restent donc moelleuses et fondantes. La conservation au congélateur n'a donc pas pour objectif de congeler le pollen. La congélation sert uniquement à préserver l'ensemble de ses nutriments, en particulier ceux sensibles au températures positives tels que les acides aminés.

Si un produit décongelé ne jamais être recongelé, le pollen est l'exception qui confirme la règle ! Barquette fermée, il peut être décongelé et recongelé plusieurs fois sans subir aucune dégradation. Avec son faible taux d'humidit, il n’y a pas de formation de cristaux de glace lors de sa congélation. Son refroidissement ne provoque donc pas d’éclatement cellulaire qui favoriserait un milieu propice à la prolifération bactérienne.